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Rafael Campos, M. Sc.

 

PhD Student

 

AG Computational Biology

Telefon: +49(0)221 478 96505

Email: camposSpamProtectionmpipz.mpg.de

 

 

 

Forschungsschwerpunkte

  • Anwendung von Hidden Markov Modellen für Genomsegmentierung
  • Verwaltung und Aktualisierung des Bioconductor-Moduls STAN 
  • Analyse von ChIP-seq Experimenten, Gentranskription, Histonmodifikation

Berufserfahrung

2016 – 2018     Bioconductor (STAN)   

2014 – 2018     Lehre und Graduiertenbetreuung im Omic’s-Modul, Universität zu Köln

2012 – 2013     Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Universitat de Vic, Barcelona, Spanien


Bildungsweg

2014 – heute    Promotion in Bioinformatik, Max-Planck-Institut für Pflanzenzüchtungsforschung, Köln 

2013 – 2014     M. Sc. Omic’s Datenanalyse, Universitat de Vic, Barcelona

2010 – 2013     B. Sc. Biochemie, Universitat Rovira i Virgili, Tarragona

2007 – 2013     B. Sc. Chemie, Universitat Rovira i Virgili, Tarragona


Ausgewählte Publikationen

Campos-Martin, R., Duemke, S., Zacher, B., Gagneur, J., Tresch, A. 2018. STAN: an R/Bioconductor package for flexible and efficient annotation of genomic data using bidirectional hidden Markov models. Source Code for Biology and Medicine. Under Review

Franzen, K., Fliegen, S., Koester, J., Martin, R.C., Deuschl, G., Reppel, M., Mortensen, K. and Schneider, S.A., 2017. Central hemodynamics and arterial stiffness in idiopathic and multiple system atrophy. Journal of neurology, 264(2), pp.327-332.

Vandivier, L.E., Campos, R., Kuksa, P.P., Silverman, I.M., Wang, L.S. and Gregory, B.D., 2015. Chemical modifications mark alternatively spliced and uncapped messenger RNAs in Arabidopsis. The Plant Cell, pp.tpc-15.