Die Regulierung der Genexpression ist von entscheidender Bedeutung für die Funktionalität der Zelle. Koordinierte Veränderungen der Genexpression sind entscheidend für den Zellzyklus, für Umweltanpassungen und für die Zelldifferenzierung. In diesem Projekt entwickeln wir einen neuen biochemisch-bioinformatischen Ansatz für die Messung der kinetischen Parameter des mRNA-Stoffwechsels (d.h. RNA-Syntheserate, Kern- und zytosolischer Abbau und RNA-Exportrate). Durch RNA-Stoffwechselmarkierung in Kombination mit Deep Sequencing (SLAM-Seq) können wir Transkripte, die nach dem Markierungsimpuls synthetisiert wurden, von bereits existierenden unterscheiden. Wir analysieren SLAM-Seq-Zeitreihendaten für nukleare und zytosolische RNA durch Anpassung eines Differentialgleichungssystems mit einem geeigneten statistischen Modell.